Catalog :




Detail Article

Indonesian Journal of Clinical Pathology and Medical Laboratory

ISSN 0854-4263

Vol. 18 / No. 2 / Published : 2012-01

Related with : Scholar   Yahoo!   Bing

Original Article :

Diagnostic test method for immunocytochemical ns1 of dengue virus, for infection diagnosis

Author :

  1. Rismawati Yaswir*1
  2. Ellyza Nasrul*2
  3. Nafiandi*3
  1. Departemen Patologi Klinik FK UNAND/RS. Dr. M. Djamil Padang Jl. Perintis Kemerdekaan Padang
  2. Departemen Patologi Klinik FK UNAND/RS. Dr. M. Djamil Padang Jl. Perintis Kemerdekaan Padang
  3. Departemen Patologi Klinik FK UNAND/RS. Dr. M. Djamil Padang Jl. Perintis Kemerdekaan Padang

Abstract :

NS1 protein is a nonstructural protein of dengue virus which are secreted into the blood. NS1 protein could be detected in blood up to nine days after the onset of illness that almost simultaneously with the occurrence of viremia. The purpose of this study is to know the result of diagnostic test method of immunocytochemical NS1 by RT-PCR on dengue virus infected patients which is diagnosed at Dr. M. Djamil hospital. Padang. The method of the research uses cross sectional analytically study with consecutive sampling of patients who diagnosed as infected with dengue virus and treated in the interne ward of Dr. M. Djamil General Hospital Padang from January up  to August 2011. Patient ‘s venous blood was taken about 5 mL and then centrifuged 3500 rpm and then the  serum is separated and stored at-20oC until the sample  is examined. The examination of NS1 serum is carried out by immunocytochemical method followed by the inspection of RNA viruses and their serotypes by RT-PCR and continued by agarose gel electrophoresis on 1.5 up to 2%. From the sixty samples obtained showed: 71.6% tested positive immunocytochemical NS1, 28.4% negative immunocytochemical NS1, 76.7% positive RT-PCR and 23.3% negative RT-PCR, 23.9% Den1, 43.3% Den2, 26.1% Den3, and 6.5% Den4. The immunocytochemical NS1 diagnostic test obtained RT-PCR sensitivity of 85%, specificity 71%, positive predictive value 90%, and negative predictive value 59%. The immunocytochemical NS1 has a quite high sensitivity, and low specificity, where as the positive predictive value is quite high, but the negative predictive value is lower than the RT-PCR for the diagnosis of dengue virus infection.     Protein NS1 merupakan protein nonstruktural virus dengue tertentu yang disekresikan ke dalam darah. Protein NS1 ini dapat ditemukan dalam darah sampai hari ke sembilan setelah permulaan penyakit yang hampir bersamaan dengan kejadian viremia. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui hasil uji diagnostik metode imunositokimia NS1 dengan RT-PCR di pasien yang didiagnosis terinfeksi virus dengue (VD) di RS. Dr. M. Djamil Padang. Penelitian dilakukan secara potong silang dengan analitik pengambilan contoh berurutan dari penderita yang didiagnosis terinfeksi virus dengue dan dirawat di Bagian Penyakit Dalam Rumah Sakit Dr. M. Djamil Padang dari Bulan Januari sampai Agustus 2011. Darah vena penderita diambil sebanyak 5 mL kemudian dipusingkan dengan kecepatan  3500 rpm dan kemudian serumnya dipisahkan serta disimpan pada suhu -20oC sampai dilakukan pemeriksaan. Serum diperiksa dengan metode imunositokimia NS1 dan pemeriksaan virus RNA serta serotipe virusnya dengan RT-PCR yang dilanjutkan dengan elektroforesis gel agarose 1,5-2%. Analisis dilakukan dengan menggunakan SPSS 16. Hasil ditampilkan dalam bentuk tabel dan gambar. Enam puluh sampel yang diperiksa didapatkan 71,6% positif imunositokimia NS1, 28,4% negatif imunositokimia NS1, 76,7% positif RT-PCR dan 23,3% negatif RT-PCR, Den1 23,9%, Den2 43,3%, Den3 26,1% serta Den4 6,5%. Uji diagnostik imunositokimia NS1 terhadap RT-PCR didapatkan kepekaan 85%, kekhasan 71%, nilai ramalan positif 90%, dan yang negatif 59%. Imunositokimia NS1 memiliki kepekaan cukup tinggi, kekhasan, nilai ramalan positif yang cukup tinggi, sedangkan untuk diagnosis infeksi virus dengue nilai prediksi negatif lebih rendah dibandingkan dengan yang untuk RT-PCR.

Keyword :

NS1 protein, virus dengue serotype, Immunocytochemical, RT-PCR,


References :

  1. Kuno G, Chang K, Tsuchiya N, Karabatsos, and Cropp C, (1998). Phylogeny of the Genus Flaviviru’s. USA : J. Virol
  2. Trent D, Manske G, Fox, M, Chu S, Kliks, and Monath T, (1990). The Molecular Epidemiology of Dengue Viruses, Genetic Variation and Microevolution’. USA : Appl. Virol. Res
  3. Kristina, Isminah, Leni W, (2004). Kajian Kesehatan Demam Berdarah Dengue. Jakarta : Badan Penelitian dan Pengembangan Kesehatan Departemen Kesehatan
  4. Malavige GN, Fernando S, Fernando DJ, and Seneviratne SL, (2004). Dengue Viral Infections. USA : Postgraduate Medicine Journal
  5. Wuryadi S, (2004). Diagnosis Laboratorium Infeksi Virus Dengue, dalam ‘Demam Berdarah Dengue Naskah Lengkap. Jakarta : Balai Penerbit FK.UI


   


Archive Article

Cover Media Content

Volume : / No. : / Pub. :