Indonesian Journal of Clinical Pathology and Medical Laboratory
ISSN 0854-4263
Vol. 20 / No. 2 / Published : 2014-01
Order : 8, and page :111 - 115
Related with : Scholar Yahoo! Bing
Original Article :
Genotypes and subtypes of hepatitis b virus in chronic active hepatitis b infection
Author :
- Gondo Mastutik*1
- Juniastuti*2
- Ali Rohman*3
- Mochamad Amin*4
- Poernomo Boedi Setiawan*5
- Dosen Fakultas Kedokteran
- Dosen Fakultas Kedokteran
- Dosen Fakultas Sains dan Teknologi
- Laboratorium Hepatitis Lembaga Penyakit Tropis Universitas Airlangga
- Dosen Fakultas Kedokteran
Abstract :
Infeksi virus hepatitis B (VHB) di penderita kronik aktif dapat menyebabkan pengerasan jaringan hati (liver sirosis) atau karsinoma hepatosel. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui pembawaan sifat (genotipe) dan subtipe VHB dari penderita infeksi hepatitis B kronik aktif dengan menganalisisnya di Surabaya. Genotipe VHB ditentukan dengan membandingkan sekuen gen S dengan yang terdapat di GenBank. Pohon filogenetik dibuat dengan menggunakan cara kelompok pasangan tanpa penimbangan menggunakan rerata hitungan (unweighted-pair group method using arithmetic averages). Subtipe VHB diduga berdasarkan peramalan sekuen asam amino 116 sampai 183 pada HBsAg dengan cara multiple alignment sequences menggunakan ClustalW2. Penelitian ini menggunakan 20 serum penderita pengidap infeksi hepatitis B kronik aktif. Setelah direaksikan Polymerase Chain Reaction (PCR) dan sekuensing, didapatkan 13 sampel yang dapat digunakan untuk analisis sekuen. Hasil telitian menunjukkan bahwa semua penderita hepatitis B pada penelitian ini (13 sampel) terinfeksi VHB genotipe B. Subtipe adw2 ditemukan di 12 dari 13 serum, dan satu (1) yang memiliki ayw1. Subtipe adw2 banyak ditemukan di Indonesia, yaitu di Pulau Sumatra, Jawa, Kalimantan Selatan, Bali, Lombok, Ternate, dan Morotai. Pada penelitian ini sampel yang digunakan berasal dari Surabaya (Pulau Jawa). Subtipe ayw1 banyak ditemukan di Nusa Tenggara dan Maluku. Penderita hepatitis B kronik aktif yang terinfeksi VHB memiliki subtipe ayw1, pada penelitian ini berasal dari Nusa Tenggara. Berdasarkan telitian ini dapat disimpulkan, bahwa VHB yang menginfeksi penderita hepatitis B kronik aktif di Surabaya adalah genotipe B dan di subtipe adw2 dari penderita yang berasal dari Surabaya dan yang ayw1 berasal dari penderita Nusa Tenggara.
Keyword :
Genotype, subtype, S gene, hepatitis B virus, the chronic active hepatitis B infection,
References :
9. Lusida MI, Surayah, Sakugawa H, Nagano-Fujii M, Soetjipto, Mulyanto, Handajani R, Boediwarsono, S,(2003) Genotype and subtype analyses of hepatitis B virus (HBV) and possible co-infection of HBV and hepatitis C virus (HCV) or hepatitis D virus (HDV) in blood donors, patients with chronic liver disease and patients on hemodialysis in Surabaya, Indonesia Surabaya : Microbiol Immunol
Archive Article
| Cover Media | Content |
|---|---|
Volume : 20 / No. : 2 / Pub. : 2014-01 |
|




