Catalog :




Detail Article

Indonesian Journal of Clinical Pathology and Medical Laboratory

ISSN 0854-4263

Vol. 20 / No. 2 / Published : 2014-01

TOC : 8, and page :111 - 115

Related with : Scholar   Yahoo!   Bing

Original Article :

Genotypes and subtypes of hepatitis b virus in chronic active hepatitis b infection

Author :

  1. Gondo Mastutik*1
  2. Juniastuti*2
  3. Ali Rohman*3
  4. Mochamad Amin*4
  5. Poernomo Boedi Setiawan*5
  1. Dosen Fakultas Kedokteran
  2. Dosen Fakultas Kedokteran
  3. Dosen Fakultas Sains dan Teknologi
  4. Laboratorium Hepatitis Lembaga Penyakit Tropis Universitas Airlangga
  5. Dosen Fakultas Kedokteran

Abstract :

Infeksi virus hepatitis B (VHB) di penderita kronik aktif dapat menyebabkan pengerasan jaringan hati (liver sirosis) atau karsinoma hepatosel. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui pembawaan sifat (genotipe) dan subtipe VHB dari penderita infeksi hepatitis B kronik aktif dengan menganalisisnya di Surabaya. Genotipe VHB ditentukan dengan membandingkan sekuen gen S dengan yang terdapat di GenBank. Pohon filogenetik dibuat dengan menggunakan cara kelompok pasangan tanpa penimbangan menggunakan rerata hitungan (unweighted-pair group method using arithmetic averages). Subtipe VHB diduga berdasarkan peramalan sekuen asam amino 116 sampai 183 pada HBsAg dengan cara multiple alignment sequences menggunakan ClustalW2. Penelitian ini menggunakan 20 serum penderita pengidap infeksi hepatitis B kronik aktif. Setelah direaksikan Polymerase Chain Reaction (PCR) dan sekuensing, didapatkan 13 sampel yang dapat digunakan untuk analisis sekuen. Hasil telitian menunjukkan bahwa semua penderita hepatitis B pada penelitian ini (13 sampel) terinfeksi VHB genotipe B. Subtipe adw2 ditemukan di 12 dari 13 serum, dan satu (1) yang memiliki ayw1. Subtipe  adw2 banyak ditemukan di Indonesia, yaitu di Pulau Sumatra, Jawa, Kalimantan Selatan, Bali, Lombok, Ternate, dan Morotai. Pada  penelitian ini sampel yang digunakan berasal dari Surabaya (Pulau Jawa). Subtipe ayw1 banyak ditemukan di Nusa Tenggara dan Maluku. Penderita hepatitis B kronik aktif yang terinfeksi VHB memiliki subtipe ayw1, pada penelitian ini berasal dari Nusa Tenggara. Berdasarkan telitian ini dapat disimpulkan, bahwa VHB yang menginfeksi penderita hepatitis B kronik aktif di Surabaya adalah genotipe B dan di subtipe adw2 dari penderita yang berasal dari Surabaya dan yang ayw1 berasal dari penderita Nusa Tenggara.

Keyword :

Genotype, subtype, S gene, hepatitis B virus, the chronic active hepatitis B infection,


References :

  1. 9. Lusida MI, Surayah, Sakugawa H, Nagano-Fujii M, Soetjipto, Mulyanto, Handajani R, Boediwarsono, S, (2003). Genotype and subtype analyses of hepatitis B virus (HBV) and possible co-infection of HBV and hepatitis C virus (HCV) or hepatitis D virus (HDV) in blood donors, patients with chronic liver disease and patients on hemodialysis in Surabaya, Indonesia. Surabaya : Microbiol Immunol


   


Archive Article

Cover Media Content

Volume : 20 / No. : 2 / Pub. : 2014-01
  1. Bromcresol green (bcg) and bromcresol purple (bcp) methods in liver cirrhosis receiving albumin infusion
  2. Fib-4 score and highly active anti retroviral therapy among hiv infected patients
  3. Associations between age, age at onset, disease duration with esr, crp, das20-esr in rheumatoid arthritis
  4. Testing of aerobic pathogenic bacteria in central operating rooms
  5. Rusip related to the lipid profile in hypercholesterolemia
  6. Mean platelet volume, white blood cell and platelet count in acute appendicitis
  7. Generic simvastatin
  8. Genotypes and subtypes of hepatitis b virus in chronic active hepatitis b infection
  9. The prediction of sepsis due to procalcitonin related to clinical outcome
  10. Plasma levels of tgf-β1 and cd4+ t-lymphocytes in stage i hiv-infected patients
  11. Ethanol extract and ethyl acetate of alang-alang (imperata cylindrica) on superoxide dismutase (sod)
  12. Conserved sequences and hiv-1
  13. Effects of cigarette smoking on laboratory aspirin resistance
  14. Potassium levels in stored packed red cells
  15. Validity of engrailed-2 in prostate cancer
  16. Update biomarkers of lupus nephritis
  17. Examination of ckmb and high sensitive troponin t in non-st segment elevation myocardial infarction patients