Journal of Basic Medical Veterinary
ISSN 2302-6820
Vol. 2 / No. 1 / Published : 2013-06
Order : 3, and page :89 - 94
Related with : Scholar Yahoo! Bing
Original Article :
Serial passage changed nukleotide composition of protein coding genes prm den-3 virus
Author :
- Bagus Ryan Permadi*1
- Adi Prijo Rahardjo*2
- Ngakan Made Rai Widjaja*3
- Fedik Abdul Rantam*4
- Mahasiswa FKH Unair
- Bagian Virologi Veteriner FKH Unair
- Departemen KDV FKH Unair
- Bagian Virologi Veteriner Unair
Abstract :
Virus dengue adalah penyebab penyakit demam dengue (DD) dan demam berdarah dengue (DBD. Virus dengue mempunyai empat jenis serotipe yaitu: DEN-1, DEN-2 dan DEN-3 serta DEN-4. Serotipe DEN-2 dan DEN-3 merupakan serotipe yang dominan di Indonesia. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui bagaimana susunan nukleotida gen pengkode protein PrM virus DEN-3 setelah dilakukan pasase berulang dengan menggunakan teknik sekuensing. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Oktober 2012 sampai Juni 2013 di Laboratorium Dengue dan Stemcell Institut Tropical Disease (ITD) Universitas Airlangga Surabaya. Bahan yang digunakan dalam penelitian ini adalah virus DEN-3 isolat ITD Universitas Airlangga sebelum dan sesudah dipasase. Variabel yang diamati pada penelitian ini adalah urutan nukleotida fragmen gen pengkode protein PrM virus DEN-3 sebelum dipasase dan setelah dipasase 10, 20 dan 30 kali. Data yang diperoleh dalam bentuk urutan nukleotida gen pengkode protein PrM virus DEN-3 isolat Institute Tropical Desease (ITD) dianalisis dengan menggunakan program Bioedit yang kemudian diamati perbedaan susunannya dari tiap pasase. Hasil penelitian menunjukkan bahwa susunan nukleotida gen pengkode protein PrM virus DEN-3 setelah dilakukan pasase berulang terjadi perubahan berupa 18 delesi dan 34 substitusi, sedangkan homologinya sebesar 96%.
Keyword :
pasase, DEN-3, , homologi, PrM, , nukleotida, protein,
References :
Widjaja, S,(2010) Virological and Immunological Studies of Dengue Virus Infection in Pigtail Macaques (Macaca nemestrina Bogor : Program Pascasarjana Institut Pertanian
WHO,(2009) Dengue guidelines for diagnosis, treatment, prevention and control Geneva : New edition
Archive Article
Cover Media | Content |
---|---|
![]() Volume : 2 / No. : 1 / Pub. : 2013-06 |
|