UNIVERSITAS AIRLANGGA



Detail Article

Journal of Basic Medical Veterinary

ISSN 2302-6820

Vol. 2 / No. 1 / Published : 2013-06

Order : 3, and page :89 - 94

Related with : Scholar   Yahoo!   Bing

Original Article :

Serial passage changed nukleotide composition of protein coding genes prm den-3 virus

Author :

  1. Bagus Ryan Permadi*1
  2. Adi Prijo Rahardjo*2
  3. Ngakan Made Rai Widjaja*3
  4. Fedik Abdul Rantam*4
  1. Mahasiswa FKH Unair
  2. Bagian Virologi Veteriner FKH Unair
  3. Departemen KDV FKH Unair
  4. Bagian Virologi Veteriner Unair

Abstract :

  Virus dengue adalah penyebab penyakit demam dengue (DD) dan demam berdarah dengue (DBD. Virus dengue mempunyai empat jenis serotipe yaitu: DEN-1, DEN-2 dan DEN-3 serta DEN-4. Serotipe DEN-2 dan DEN-3 merupakan serotipe yang dominan di Indonesia. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui bagaimana susunan nukleotida gen pengkode protein PrM virus DEN-3 setelah dilakukan pasase berulang dengan menggunakan teknik sekuensing. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Oktober 2012 sampai Juni 2013 di Laboratorium Dengue dan Stemcell Institut Tropical Disease (ITD) Universitas Airlangga Surabaya. Bahan yang digunakan dalam penelitian ini adalah virus DEN-3 isolat ITD Universitas Airlangga sebelum dan sesudah dipasase. Variabel yang diamati pada penelitian ini adalah urutan nukleotida  fragmen gen pengkode protein PrM virus DEN-3 sebelum dipasase dan setelah dipasase 10, 20 dan 30 kali. Data yang diperoleh dalam bentuk urutan nukleotida gen pengkode protein PrM virus DEN-3 isolat Institute Tropical Desease (ITD) dianalisis dengan menggunakan program Bioedit yang kemudian diamati perbedaan susunannya dari tiap pasase. Hasil penelitian menunjukkan bahwa susunan nukleotida gen pengkode protein PrM virus DEN-3 setelah dilakukan pasase berulang terjadi perubahan berupa 18 delesi dan 34 substitusi, sedangkan homologinya sebesar 96%.

Keyword :

pasase, DEN-3, , homologi, PrM, , nukleotida, protein,


References :

Widjaja, S,(2010) Virological and Immunological Studies of Dengue Virus Infection in Pigtail Macaques (Macaca nemestrina Bogor : Program Pascasarjana Institut Pertanian

WHO,(2009) Dengue guidelines for diagnosis, treatment, prevention and control Geneva : New edition





Archive Article

Cover Media Content

Volume : 2 / No. : 1 / Pub. : 2013-06
  1. The Inhibition Effect Of Pasteurella Multocida Growth By Crescentia Cujete L Leaf Extract
  2. Detection Of Antibody Against Avian Influenza Virus H5 In Pigeons (columba Livia) Sold At One Of The Biggest Wet Market Of Surabaya
  3. Serial Passage Changed Nukleotide Composition Of Protein Coding Genes Prm Den-3 Virus
  4. Meat Cholesterol Levels Of Broiler Chicken Male With Combinations Of Seligi (phyllanthus Buxifolius) And Turmeric (curcuma Domestica) Flour On Feeds
  5. Antibacterial Potency Of Juice Cananga (cananga Odorata (lam.) Hook.f.&thomson) Leaves To Staphylococcus Aureus By In Vitro Method
  6. Chdw And Chdz Gene Identification Based On Parakeet (melopsittacus Undulatus) Feathers To Determine Sex By Pcr (polymerase Chain Reaction) Method
  7. Isolation And Identication Of Avian Influenza H5n1 Viruses In Quail In East Java Province
  8. Immunostimulatory Effect Of Ethanolic Extract Of Tekelan Leaf (chromolaena Odorata L.) For Macrophage Activity On Mice Induced By Staphylococcus Aureus